SISTEMA BIOINFORMATICO PER IL CRO
28/11/2014
Un sistema bioinformatico che individua i possibili partner di interazione per ogni proteina, incluse quelle coinvolte nella generazione dei tumori, è stato realizzato da Roberta Maestro del Cro di Aviano e Igor Jurisica del Princess Margareth Hospital Toronto. Lo studio è stato pubblicato dalla rivista Nature Methods poiché la ricerca, hanno commentato i due, ha un importante impatto sia in ambito conoscitivo sia terapeutico. Infatti, capire il codice di interazione tra proteine e in che modo questo viene alterato nella cellula tumorale, è cruciale per decodificare i meccanismi di trasformazione neoplastica e costituisce la premessa per lo sviluppo di nuovi approcci terapeutici. L'individuazione di nuove interazioni tra proteine coinvolte nel tumore, spiegano al Cro, apre idealmente la strada allo sviluppo di nuove terapie mirate a rendere inefficaci queste interazioni e quindi a restituire alle proteine con funzione oncosoppressoria la loro capacità di inibire la crescita tumorale. Alcuni farmaci molecolari che bloccano l'interazione tra due proteine sono già stati introdotti in clinica e stanno dando risultati promettenti nella cura di alcuni tumori. "La vita e il destino di una cellula - spiega Maestro - dipendono da intricati sistemi di regolazione che sono presieduti da geni e dai loro effettori, le proteine. Molte funzioni biologiche sono mediate da interazioni fisiche tra diverse proteine. Questi complessi sistemi di regolazione mediati da interazioni tra proteine sono spesso alterati nelle cellule tumorali, che di conseguenza hanno una percezione alterata dei 'segnali'". Il gruppo di ricerca coordinato da Maestro, direttore Unità Oncologia Sperimentale 1 CRO di Aviano, da anni si interessa delle interazioni tra proteine nel cancro. Nel 2012 era stato scoperto che due proteine con funzione opposta, una promuovente la trasformazione neoplastica, Twist, ed una inibitoria della formazione di tumori, l'oncosoppressore p53, interagivano. In conseguenza la funzione soppressoria di p53 veniva abrogata, lasciando campo libero a Twist di formare tumori. Jurisica è invece un bioinformatico, cioè un ricercatore che si occupa della generazione di algoritmi per simulare, tramite analisi al computer, il comportamento biologico di molecole; da tempo si interessa di interazioni tra proteine.